El 28 de enero jugó su primer partido de FA Cup en la derrota por dos a uno ante el Liverpool que eliminó al Manchester United de esta competición en los dieciseisavos de final. Durante la temporada 2012-13, tras un comienzo algo irregular acompañado de problemas dentales que le hicieron estar en el banquillo en algunos partidos, se afianzó en la titularidad del equipo inglés. En la primera temporada en Inglaterra De Gea alternó la titularidad con el danés Anders Lindegaard, disputando un total de 39 partidos entre las distintas competiciones y acabando subcampeón de la Premier League y campeón de la Community Shield.
