Terminaría su primera temporada en Alemania con 26 goles en 40 partidos jugados, camiseta manchester united siendo su mejor temporada en la historia terminando en el cuarto lugar de goleadores con 17 goles. Marcó a los seis minutos de tiempo de descuento contra el rival local, el Manchester City, permitiendo la victoria del United en el derby por 4 goles a 3. Este era el cuarto derby en el que marcaba Owen, después del de Merseyside, El Clásico de Inglaterra y el Tyne-Wear derby en años anteriores.
